Package org.biojava.nbio.structure.chem

Class ChemCompAtom

java.lang.Object
org.biojava.nbio.structure.chem.ChemCompAtom
All Implemented Interfaces:
Serializable, CifBean
public class ChemCompAtom extends Object implements CifBean
Properties of an atom of a chemical component.
Since:
6.0.0
Author:
Sebastian Bittrich
See Also:

  • Constructor Details

    • ChemCompAtom

      public ChemCompAtom()

  • Method Details

    • getCompId

      public String getCompId()

    • setCompId

      public void setCompId(String compId)

    • getAtomId

      public String getAtomId()

    • setAtomId

      public void setAtomId(String atomId)

    • getAltAtomId

      public String getAltAtomId()

    • setAltAtomId

      public void setAltAtomId(String altAtomId)

    • getTypeSymbol

      public String getTypeSymbol()

    • setTypeSymbol

      public void setTypeSymbol(String typeSymbol)

    • getCharge

      public int getCharge()

    • setCharge

      public void setCharge(int charge)

    • getPdbxAlign

      public int getPdbxAlign()

    • setPdbxAlign

      public void setPdbxAlign(int pdbxAlign)

    • getPdbxAromaticFlag

      public String getPdbxAromaticFlag()

    • setPdbxAromaticFlag

      public void setPdbxAromaticFlag(String pdbxAromaticFlag)

    • getPdbxLeavingAtomFlag

      public String getPdbxLeavingAtomFlag()

    • setPdbxLeavingAtomFlag

      public void setPdbxLeavingAtomFlag(String pdbxLeavingAtomFlag)

    • getPdbxStereoConfig

      public String getPdbxStereoConfig()

    • setPdbxStereoConfig

      public void setPdbxStereoConfig(String pdbxStereoConfig)

    • getModelCartnX

      public double getModelCartnX()

    • setModelCartnX

      public void setModelCartnX(double modelCartnX)

    • getModelCartnY

      public double getModelCartnY()

    • setModelCartnY

      public void setModelCartnY(double modelCartnY)

    • getModelCartnZ

      public double getModelCartnZ()

    • setModelCartnZ

      public void setModelCartnZ(double modelCartnZ)

    • getPdbxModelCartnXIdeal

      public double getPdbxModelCartnXIdeal()

    • setPdbxModelCartnXIdeal

      public void setPdbxModelCartnXIdeal(double pdbxModelCartnXIdeal)

    • getPdbxModelCartnYIdeal

      public double getPdbxModelCartnYIdeal()

    • setPdbxModelCartnYIdeal

      public void setPdbxModelCartnYIdeal(double pdbxModelCartnYIdeal)

    • getPdbxModelCartnZIdeal

      public double getPdbxModelCartnZIdeal()

    • setPdbxModelCartnZIdeal

      public void setPdbxModelCartnZIdeal(double pdbxModelCartnZIdeal)

    • getPdbxComponentCompId

      public String getPdbxComponentCompId()

    • setPdbxComponentCompId

      public void setPdbxComponentCompId(String pdbxComponentCompId)

    • getPdbxResidueNumbering

      public String getPdbxResidueNumbering()

    • setPdbxResidueNumbering

      public void setPdbxResidueNumbering(String pdbxResidueNumbering)

    • getPdbxComponentAtomId

      public String getPdbxComponentAtomId()

    • setPdbxComponentAtomId

      public void setPdbxComponentAtomId(String pdbxComponentAtomId)

    • getPdbxPolymerType

      public String getPdbxPolymerType()

    • setPdbxPolymerType

      public void setPdbxPolymerType(String pdbxPolymerType)

    • getPdbxRefId

      public String getPdbxRefId()

    • setPdbxRefId

      public void setPdbxRefId(String pdbxRefId)

    • getPdbxComponentId

      public String getPdbxComponentId()

    • setPdbxComponentId

      public void setPdbxComponentId(String pdbxComponentId)

    • getPdbxOrdinal

      public int getPdbxOrdinal()

    • setPdbxOrdinal

      public void setPdbxOrdinal(int pdbxOrdinal)